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華中農(nóng)業(yè)大學(xué)油菜團(tuán)隊開發(fā)aChIP技術(shù)揭示油菜干種子表觀遺傳調(diào)控新模式

發(fā)布日期:2024/10/28 11:02:18 點擊數(shù):94

      華中農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳改良全國重點實驗室油菜遺傳改良創(chuàng)新團(tuán)隊趙倫課題組研究開發(fā)了一種普遍適用于植物經(jīng)濟(jì)器官的aChIP技術(shù),以油菜為例,首次解析了作物種子休眠和萌發(fā)過程中組蛋白修飾景觀的動態(tài)變化及其潛在功能。本研究通過創(chuàng)新染色質(zhì)分離策略,開發(fā)了aChIP技術(shù)。aChIP能夠同時有效去除植物細(xì)胞壁和細(xì)胞內(nèi)含物,顯著提高染色質(zhì)提取效率和免疫共沉淀效率。aChIP技術(shù)適用于所有測試的14種植物經(jīng)濟(jì)器官(包括油菜、大豆、玉米、水稻和擬南芥種子、番茄果實、土豆塊莖、橙子果皮和果肉、康乃馨花瓣、甘蔗和楊樹莖稈等),成功繪制了多種代表性組蛋白修飾圖譜并鑒定了染色質(zhì)蛋白(如轉(zhuǎn)錄因子CAMTA3、DNA結(jié)合蛋白MBD7和DNA去甲基化酶DME)的全基因組結(jié)合位點。這些結(jié)果證明aChIP對不同作物經(jīng)濟(jì)器官的普適性和穩(wěn)定性。本研究還深入探究了油菜種子休眠和萌發(fā)過程的表觀遺傳調(diào)控模式。利用aChIP技術(shù)產(chǎn)出了油菜開花后50天種子、干種子、萌發(fā)種子和幼葉中5種代表性的高質(zhì)量組蛋白修飾數(shù)據(jù)。綜上所述,aChIP是一種高質(zhì)、高效、靈敏、穩(wěn)定的植物高階ChIP-seq技術(shù),適用于所有測試的植物器官,特別是作物重要經(jīng)濟(jì)器官。這一技術(shù)將顯著推進(jìn)油菜等作物經(jīng)濟(jì)器官表觀基因組和功能基因組研究,為作物遺傳改良提供堅實的技術(shù)基礎(chǔ)。研究成果發(fā)表于《Nature Plants》。

 
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