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中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江所成功研發(fā)首個(gè)鱖魚40K cGPS液相育種芯片“鱖芯1號(hào)”

發(fā)布日期:2024/10/28 10:54:01 點(diǎn)擊數(shù):75

        中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所鱖鱸基因組學(xué)與選擇育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)與華智生物技術(shù)有限公司合作,利用cGPS(Genotyping by Pinpoint Sequencing of captured targets)靶向測(cè)序技術(shù),研發(fā)了具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的首個(gè)鱖魚40K液相育種芯片“鱖芯1號(hào)”。該芯片可應(yīng)用于鱖魚種質(zhì)資源鑒定、遺傳多樣性評(píng)估、基因定位與挖掘鑒定、全基因組關(guān)聯(lián)分析、分子輔助定向改良和智能育種等不同場景,為鱖魚遺傳研究和品種選育提供了高效基因型鑒定工具。利用該芯片可篩選獲得優(yōu)良性狀的鱖魚新品種,還將進(jìn)一步降低選育成本,助力鱖魚全基因組選育和良種創(chuàng)新研究。該芯片位點(diǎn)多態(tài)性高、基因組分布均勻,位點(diǎn)在染色體上的平均覆蓋率為99.87%,平均間距17Kb。性狀關(guān)聯(lián)位點(diǎn)豐富,芯片包括團(tuán)隊(duì)前期研究篩選獲得的鱖魚馴食、性別和生長性狀關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記554個(gè),可用于生長、性別和馴食等重要性狀的精準(zhǔn)鑒定和挖掘利用。芯片技術(shù)參數(shù)優(yōu)良,平均位點(diǎn)檢出率為99.35%,重復(fù)樣本基因型平均一致率為99.51%,與重測(cè)序樣本基因型比對(duì)平均一致率為99.11%。芯片整體性能優(yōu)良,穩(wěn)定性好,基因型準(zhǔn)確度高。

 
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